Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EAF2Q96CJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms