Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms