Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms