Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EME1Q96AY2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EME1Q96AY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME1Q96AY2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms