Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1MTQ969P6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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