Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP7Q93009 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP7Q93009 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP7Q93009 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP7Q93009 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms