Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLP1Q92989 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms