Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HTRA1Q92743 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA1Q92743 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms