Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPDL3AQ92484 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms