Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DNAAF4Q8WXU2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms