Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPC1Q8WXF1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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