Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF31Q8WWY3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms