Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C7orf43Q8WVR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms