Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCAF4Q8WV16 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms