Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROKR1Q8TCW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROKR1Q8TCW9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms