Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-11■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-11■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 TRIQK-202ENST00000517540 1753 ntTSL 310.24□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-9■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.622e-9■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-21■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-209ENST00000498239 1957 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-201ENST00000357172 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-210ENST00000545121 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 57.57□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 CEPT1-203ENST00000467362 5300 ntTSL 23.77□□□□□ -1.811e-8■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-58■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 INSIG1-206ENST00000476756 1320 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-58■■■■■ 47
PUM2Q8TB72 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 220.87■□□□□ 0.932e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 218.89■□□□□ 0.612e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 218.59■□□□□ 0.572e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 215.89■□□□□ 0.132e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 ZBED1-205ENST00000515319 905 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 26.98□□□□□ -1.292e-17■■■■■ 46.9
PUM2Q8TB72 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.951e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.091e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.171e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.231e-13■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 FBXO5-203ENST00000477822 2610 ntTSL 26.57□□□□□ -1.363e-23■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ELMO2-207ENST00000452857 2158 ntTSL 510.24□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ELMO2-212ENST00000467800 4121 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 46.8
PUM2Q8TB72 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 46.7
PUM2Q8TB72 MIR4458HG-201ENST00000502001 1005 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 46.7
PUM2Q8TB72 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 46.7
PUM2Q8TB72 GRK6-210ENST00000515666 2141 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-13■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 PAXBP1-207ENST00000466846 3879 ntTSL 23.43□□□□□ -1.866e-9■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.82e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.762e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-217ENST00000560570 2321 ntTSL 210.19□□□□□ -0.782e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-211ENST00000559085 2538 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.852e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-205ENST00000397624 2748 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-201ENST00000314177 2775 ntTSL 29.3□□□□□ -0.922e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 MEIS2-220ENST00000560702 3230 ntTSL 56.47□□□□□ -1.372e-15■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-31■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-31■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-31■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-31■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 SCAF8-206ENST00000479234 281 ntTSL 56.07□□□□□ -1.446e-14■■■■■ 46.6
PUM2Q8TB72 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 RAB13-202ENST00000462680 2123 ntTSL 210.7□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.699e-10■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 46.5
PUM2Q8TB72 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 TAOK3-219ENST00000543709 597 ntTSL 36.35□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.779e-7■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.469e-16■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.119e-16■■■■■ 46.4
PUM2Q8TB72 CNKSR3-202ENST00000433165 2347 ntTSL 1 (best)7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.441e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 PRRT1-205ENST00000472641 1355 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 PRRT1-204ENST00000467780 1361 ntTSL 214.3□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 PRRT1-210ENST00000495191 2782 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 46.3
PUM2Q8TB72 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 TRIM35-204ENST00000521283 619 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 519.58■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 315.95■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-323■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-323■■■■■ 46.2
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 216.9 ms