Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PJA1Q8NG27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms