Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms