Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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