Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF214Q8ND24 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF214Q8ND24 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms