Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms