Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM229BQ8NBD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms