Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATD1Q8NB37 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATD1Q8NB37 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATD1Q8NB37 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATD1Q8NB37 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms