Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms