Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC17Q8N6Y2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms