Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF182Q8N6D2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF182Q8N6D2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF182Q8N6D2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RNF182Q8N6D2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RNF182Q8N6D2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RNF182Q8N6D2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RNF182Q8N6D2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RNF182Q8N6D2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF182Q8N6D2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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