Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP1Q8N474 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP1Q8N474 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms