Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EID3Q8N140 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EID3Q8N140 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EID3Q8N140 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EID3Q8N140 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EID3Q8N140 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EID3Q8N140 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EID3Q8N140 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms