Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP3Q8IZU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 464.1 ms