Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ1

CPNE9, Copine-9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE9Q8IYJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE9Q8IYJ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE9Q8IYJ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms