Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP2Q8IXW5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms