Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms