Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK2Q8IWQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms