Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms