Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX29P2Q8IUI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29P2Q8IUI4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29P2Q8IUI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29P2Q8IUI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29P2Q8IUI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29P2Q8IUI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms