Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALYREFQ86V81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms