Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH3Q86UC2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RSPH3Q86UC2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms