Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYT9Q86SS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT9Q86SS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms