Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPM2Q86SE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms