Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP1R42Q7Z4L9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R42Q7Z4L9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms