Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC6Q7Z403 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms