Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG9AQ7Z3C6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms