Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS12Q6ZW61 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS12Q6ZW61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms