Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPGS1Q6ZTW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms