Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM43Q6ZSC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM43Q6ZSC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM43Q6ZSC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms