Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRBA2Q6ZNG9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KRBA2Q6ZNG9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRBA2Q6ZNG9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KRBA2Q6ZNG9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRBA2Q6ZNG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms