Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00114Q6XXX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00114Q6XXX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms