Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RSPO2Q6UXX9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO2Q6UXX9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms