Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1Q6UXT8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms