Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWB4

PRSS55, Serine protease 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS55Q6UWB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRSS55Q6UWB4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS55Q6UWB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS55Q6UWB4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms